Пандемія: попереду великі хвилі COVID-19 та нові штами омікрону

Незважаючи на величезну кількість щеплень, здається, що COVID-19 залишиться з нами ще надовго. І ось чому.

Майже через три роки після початку пандемії, вірус SARS-CoV-2 зіткнувся з серйозним завданням, а саме – необхідністю знайти нові способи обходу імунітету, який з'явився в результаті вакцинування або був вироблений у величезної кількості людей, які перенесли інфекцію. І ось, нещодавно до нас прийшли тривожні звістки: вірус цілком здатний впоратися із цим завданням. В останні тижні увагу вчених привернули кілька нових штамів вірусу, які "навчилися" ефективно ухилятися від людського імунітету; один або кілька таких штамів цілком можуть викликати цієї осені та взимку нові великі хвилі COVID-19.

"Можна з упевненістю сказати: на нас щось таке насувається. Ймовірно, будуть різні події", - говорить Корніліус Ремер, він займається вивченням еволюції вірусів у Базельському університеті. Чи слід очікувати різкого збільшення захворюваності і смертності – це велике питання.

"Ми в даний час спостерігаємо - і це не дивно - що у вірусі відбуваються зміни, які знову допомагають йому ухилятися від імунної відповіді", - каже фахівець у галузі молекулярної епідеміології Емма Ходкрофт з університету Берна. За її словами, перед SARS-CoV-2 стоїть "все те ж завдання, з яким щороку стикаються віруси ГРВІ та грипу, а саме – необхідність повернутися до нас".

Всі штами, які, зважаючи на все, готові йому в цьому допомогти, відносяться до підтипів омікрону, що поширився за останній рік по всьому світу. Деякі з них походять від штаму BA.2, який прийшов на зміну початковому штаму BA.1, але потім у більшості регіонів його витіснив штам BA.5, який став домінувати в останні місяці. Один із них (а саме – підтип BA.2.75.2), схоже, швидко поширюється в Індії, Сінгапурі та деяких регіонах Європи. Інші нові штами, які вміють ухилятися від імунітету, походять від штаму BA.5, включаючи BQ.1.1, який був виявлений у багатьох країнах світу.

У кількох нових штамів, незважаючи на їхнє різне походження, з'явилася схожа комбінація мутацій, що сприяє подоланню імунного захисту, — це справді вражаючий приклад конвергентної еволюції. За словами біолога-еволюціоніста Джессі Блума з Онкологічного центру ім. Фред Хатчинсон, у всіх у них є зміни в півдюжині ключових локусів вірусного геному, що зумовлюють механізм, за допомогою якого нейтралізуючі антитіла, вироблені в результаті вакцинації або перенесеної інфекції, зв'язуються з вірусом.

Для того, щоб швидко оцінити, наскільки ефективно будь-який з нових підваріантів вірусу здатний обходити імунітет, вчені створюють копії шиповидних (спайкових) білків вірусів і піддають їх впливу моноклональних антитіл або сироватки, а потім з'ясовують, наскільки ефективно антитіла здатні перешкоджати зараженню клітин. За допомогою таких тестів вчені з Китаю та Швеції виявили, що спайковий білок штаму BA.2.75.2 цілком здатний успішно ухилятися майже від усіх моноклональних антитіл, що використовуються при лікуванні COVID-19. Ось чому можна припустити, що всі ці методи лікування можуть виявитися марними.

Обидві групи вчених також виявили, що штаму BA.2.75.2, зважаючи на все, дуже добре вдається долати імунний захист людини. У препринті статті, опублікованому 19 вересня, імунолог Бен Мюррелл з Каролінського інституту та його колеги стверджують, що ефективність зразків сироватки, взятих у Стокгольмі (де рівень вакцинації високий, а попередні інфекції набули широкого поширення) у вісімнадцяти донорів крові, при нейтрал. 2.75.2 порівняно зі штамом ВА.5 знижено менш ніж у шість разів. "Це найстійкіший штам із усіх, які нам доводилося досліджувати", - каже вірусолог Деніел Шевард з Каролінського інституту.

Аналогічні результати для штаму BA.2.75.2 були виявлені імунологом Юньлуном Річардом Цао з Пекінського університету та його колегами після того, як вони перевірили зразки крові сорока осіб, вакцинованих трьома дозами CoronaVac (вакцини, виготовленої з інактивованого вірусу). яких спочатку вакцинувалися, а потім після вакцинації заразилися штамами BA.1, BA.2 або BA.5. Вчені виявили, що такою ж разючою здатністю ухилятися від дії антитіл має штам BQ.1.1.

У препринті статті, оновленому 23 вересня, Цао та його колеги заявляють, що нові варіанти вірусу, мабуть, не втратили здатності міцно зв'язуватися з специфічним рецептором, розташованим на клітинах людини, за допомогою якого вірус їх заражає. Це означає, що контагіозність вірусних штамів, швидше за все, не зменшилась. Крім того, вчені навели деякі докази того факту, що внаслідок інфікування, що викликається згаданими вірусними варіантами, відбувається пропорційне збільшення кількості антитіл неправильного типу (тобто таких антитіл, які міцно зв'язуються з вірусом, проте не притуплюють його здатність заражати клітини). Ця обставина, за словами Цао, може віщувати нову потужну епідеміологічну хвилю. " Ми раніше ніколи не спостерігали такої сильної здатності вірусів ухилятися від імунітету. При цьому вірус швидко еволюціонує, – каже Цао. - Це поганий знак".

Деніел Шевард і Бен Мюррелл погоджуються з тим, що в найближчі кілька місяців слід очікувати збільшення кількості інфікованих, як це сталося минулої зими, коли з'явився омікрон-штам. Однак, на відміну від Цао, вони менш песимістичні, адже, на їхню думку, набагато більше людей уже встигли одужати після перенесеної інфекції або ревакцинуватися (зокрема за допомогою бустерної вакцини проти омікрон-штаму, вакцинація якої вже розпочалася цього місяця). В результаті, на думку Шеварда, загальний рівень антитіл підвищиться, а спектр антитіл швидше за все розшириться: "Не думаю, що ми повернулися до вихідної точки".

"Рішення про включення BA.5 до бустерної вакцини, як і раніше, нам вдається вдалим, - вважає Джессі Блум. - Бустерні вакцини завжди будуть трохи запізнюватися. І все ж, хороша новина полягає в тому, що вакцина, створена на основі штаму BA.5 , відставатиме від еволюції вірусу не так на п'ять, але в один чи два кроку " .

Наскільки велика загроза від коронавірусу, який стрімко повертається до нас? Відповідь ми отримаємо, загалом, після того, як люди заразяться новими штамами. Крім того, майбутня хвиля підкаже нам, які фактори викликають або запобігають захворюванню, що протікає у важкій формі, каже Мюррелл: "Думаю, що зима нас навчить".

Science , США