Новая смертельная форма Salmonella распространяется по странам Африки южнее Сахары, сообщает Medical News Today.
Полногеномное исследование, проведенное британскими учеными из Института Сэнгера (Wellcome Trust Sanger Institute) в Кембридже, показало, что возбудителем этого заболевания является быстро эволюционирующая новая линия бактерии Salmonella Typhimurium (iNTS), нетифоидного серовара самого распространенного вида сальмонеллы Salmonella enterica.
Результаты этой работы опубликованы в Nature Genetics.
Ученые предполагают, что быстрое распространение острого кишечного заболевания может быть следствием других эпидемий в регионе, в частности, ВИЧ-инфекции и малярии, которые ослабили иммунную систему популяции. Как заявляет руководитель исследования Чиньере Окоро (Chinyere Okoro), "уязвимость иммунной системы, обусловленная ВИЧ, малярией и плохим питанием в молодом возрасте, создала условия для того, чтобы этот смертельный патоген проник в достаточно обширную суб-сахарную популяцию, адаптировался, начал циркулировать и 'расцвел пышным цветом".
В статье Окоро с соавторами сообщают о том, что расшифровка генома возбудителя новой формы сальмонеллеза позволила им выявить две волны распространения высокопатогенной Salmonella Typhimurium из двух очагов в Южной и Центральной Африке: одна началась 52 года назад, вторая - 35 лет назад.
Заболевание смертельно в 45 процентах случаев.
"Считается, что эпидемия ВИЧ-инфекции началась в центральных регионах Африки южнее Сахары и продвигалась на восток. Динамика ее распространения сходна с той, что наблюдается во второй волне распространения новой нетифоидной сальмонеллы", - говорит Роберт Кингсли (Robert Kingsley), соавтор исследования. В других частях света нетифоидная сальмонелла вызывает острую диарею, но смертность не превышает одного процента.
Геномные исследования показали, что бактерии новой линии нетифоидной сальмонеллы эволюционировали в сторону большего подобия тифоидной сальмонелле. Авторы обращают внимание на то, что тифоидная лихорадка вызывается другим штаммом сальмонеллы, S. typhi.
Сравнение геномных поселедовательностей нового штамма Salmonella Typhimurium c штаммами этого серовара из других частей света выявило у суб-сахарной бактерии гены лекарственной устойчивости. Один из таких генов обеспечивает устойчивость к антибиотику первого ряда хлорамфениколу, и он обнаружен почти во всех образцах второй волны распространения новой нетифоидной сальмонеллы. Ученые отмечают, что этот ген отсутствует в первой волне iNTS, что означает приобретение устойчивости к хлорамфениколу в начале эволюции второй волны.
Благодаря устойчивости к антибиотику, широко применяемому для лечения кишечных инфекций, патоген получил большие возможности для выживания и распространения по региону, поясняет Гордон Дуган (Gordon Dougan), первый автор статьи.